綠能科技產業推動方案是政府五大創新產業計畫之一，也是總統的重要政見。由科技部、經濟部、國發會等相關部會及臺南市政府，共同協力規劃及推動。本計畫以太陽光電2年計畫及風力發電4年計畫為先驅，藉由內需帶動就業；並以綠能科學城作為綠能科技創新產業生態系的發展基地，以創能、節能、儲能和系統整合四大主軸，支持產業發展所需。期望以產業需求帶動研發能量，以研發能量驅動產業發展，二者相輔相成，以穩健具體地落實政府再生能源及非核家園的目標。

綠能科學城位於高鐵台南站附近，包括22.3公頃的核心區，核心區內將建置綠能科技綜合研究所及示範場域，綜合研究所之任務在結合國內學研機構、地方政府、國營事業及產業界進行綠能技術發展，｢綠能科技示範場域｣則做為前述技術之驗驗及示範場域。

除了成為綠能科技產業的推手之外，綠能科學城之規劃，將以和諧共生的概念，建造為一個智慧生態城市，無論生活型態、建設開發或生產，均盡量以循環經濟概念進行設計。它將營造一個孕育生物多樣性發展的生態環境，成為在地原生動植物的樂園，並運用綠能科技成果，諸如：智慧電網、低碳運輸系統等，建立低碳省能社區；採用智慧科技設置的設施及服務系統，將使它成為國際級的智慧城市。此外，建構具高品質生活機能的周邊環境，提高對外交通的便利性，設立國際學校，試行具誘因之安家配套措施。