由於近來歐洲H5N8亞型及亞洲H5N6亞型等高病原性禽流感疫情嚴峻，本院農委會以超前佈署精神啟動相關預警防疫機制，於11月9日與各縣市動物防疫機關盤點防疫整備工作，包含人力備置、因應疫情之防疫處置及防疫物資等，並啟動及執行下列措施：
一、強化預警機制
(一)由各直轄市、縣（市）政府持續依禽場風險高低，以逢機採樣方式加強主動監測；配合冬候鳥來臺度冬期間加強候（野）鳥排遺等採檢數；提高鴨場主動監測採檢數為原採樣數2倍。
(二)密切注意冬季候鳥遷徒路徑上游國家及國外等疫情資訊，適時透過新聞稿、函文或簡訊等提出預警，俾請相關業者提高警覺加強防疫。
(三)監控化製場化製數量異常情形回溯追蹤，及加強邊境，檢疫等，早期發現疑似案例，即時處置。
(四)辦理家禽產業相關業者及獸醫師教育訓練，提升防疫知識。
二、提升疫因應機制
(一)由各直轄市、縣（市）政府依據「H5、H7亞型禽流感防治措施」公告，督導禽場依期程改善禽舍硬體設施，並與中央政府組成聯合稽查小組，加強稽查。
(二)強化禽場建康狀況查察，共有3道關卡
1.第1道：由特約獸醫師檢查家禽健康良好後，簽署家禽健康證明書。
2.第2道：由所在地動物防疫人員配合採樣監測、疫情調查等執行現場家禽健康狀況查察。
3.第3道：家禽運至屠宰場時由屠宰衛生檢查獸醫師執行屠前及屠後檢查。
(三)持續推動「禽蛋燻蒸證明」與「運輸車輛及裝載箱籠清洗消毒措施」等措施
(四)與直轄市、縣（市）政府盤點轄內人力、物資、動物撲殺及屍體處理量能等進行編組、規劃及沙盤推演，預為因應可能發生之疫情。
(五)提升跨部會協調機制，保持聯繫管道暢通。
　　防疫不分中央與地方，須與業者齊心合作，農委會每月邀集各縣市動物防疫機關、雞鴨鵝產業協會及產業輔導機關及單位召開禽流感監測及防治檢討會議，針對國內外疫情、主被動監測及生物安全防範措施輔導進度即時提供疫情預警，各依權責共同完成禽流感各項防疫工作，建立綿密動物防疫網。