為因應中國大陸COVID-19（武漢肺炎）疫情，我國於109年1月20日成立「嚴重特殊傳染性肺炎中央流行疫情指揮中心」（以下簡稱指揮中心），並鑒於中國大陸疫情持續擴大，指揮中心於1月23日宣布二級開設，由衛生福利部陳部長時中擔任指揮官，持續統籌整合各部會資源與人力。為降低疫情移入及社區傳播風險，確保民眾健康，指揮中心持續積極規劃並執行下列各項因應策略：

一、加強邊境檢疫管制

(一)全面禁止國內旅行團赴中國旅遊，並公告中國大陸、港澳及外籍人士來臺限制，視疫情發展提升入境限制強度。

(二)加強港埠環境消毒及衛教宣導，分眾提供來臺旅客相關通知書，並持續落實疑似個案後送及社區追蹤機制。

二、強化醫療應變

(一)強化醫療體系，確保急、重症醫療照護品質及資源調度效率，並落實醫療機構感染管制。另網區應變醫院啟動收治準備，進行人力、防疫物資盤點整備，以及準備清空作業。

(二)持續擴大檢驗網絡與量能，達到在地檢驗，縮短檢體運送時間，提高診斷效率。

三、落實社區防疫

(一)加強疑似病例通報，視疫情變化適時調整通報定義。

(二)透過衛生、民政、警政體系合作，依民眾感染風險等級訂定不同監測強度，並輔以智慧科技，落實追蹤管理。

(三)預防校園群聚疫情，各級學校延後開學，已開學者加強檢測與管理。另勞動部訂有因配合防疫請假與給薪相關保障措施。

四、加強防疫儲備物資盤點及調度

(一)適時釋出儲備口罩，協調民間業者提高產能，以穩定供應。

(二)徵用國內口罩工廠，產出口罩均由指揮中心分配，並力求資源利用公平及透明。

五、結合法務部、內政部刑事警察局及國家通訊傳播委員會，提高不實訊息處辦效率。

六、加強對民眾之風險溝通

(一)增加1922諮詢專線人力及專業分工，提高回復效率。

(二)製作多元衛教素材，善用新媒體、各部會宣傳管道等，加強對民眾之風險溝通。