全民健康保險自1995年開辦後，建置資料倉儲系統，收載特約醫療院所醫療申報資料，累積24年的資料量，涵蓋全國所有納保民眾的就醫資料，是全國最大的個人醫療資料庫。全民健保資料庫應用服務相關政策有：

一、醫療資訊雲端查詢系統：幫助民眾避免重複用藥與重複檢驗，除了提升醫療品質與保護民眾健康，也減少了醫療浪費，達到政府與民眾雙贏。

二、健康存摺：讓民眾擁有自己的健康資料，可以自我健康管理，還可以授權廠商擴大資料的加值應用，達到政府、民眾與健康產業三贏。

三、全民健康保險資料人工智慧應用服務試辦：開放健保署收載且已完成去識別化的電腦斷層(CT)、核磁共振(MRI)醫療影像資料，輔以影像資料相關之全民健康保險醫療服務就醫明細、檢驗檢查報告等申報資料，提供公務機關、學術研究機構(含產業)及專業機構申請應用。

四、精準審查：透過大數據分析辦理醫療院所異常審查與追蹤，未來衛福部規劃透過整合數據資料庫辦理深入分析（如藥品療效分析），更可以提供業界加值應用，提升我國生技產業。
健保署未來將持續提供健保資料庫各項應用，促進健康醫療發展及學術研究量能(含產學合作)，全力協助台灣生技醫療產業發展與升級。