馬太鞍溪堰塞湖溢流，造成重大災情，為加速復原工作，儘速恢復居民正常生活，行政院第一時間已在花蓮成立中央災害應變中心前進協調所，由經濟部賴建信次長擔任總協調官，10月1日起提升由季政務委員連成擔任總協調官，加緊與多位部會簡任以上主管共同進駐，調度一切可用資源，全力應變及加速復原重建。

行政院業依丹娜絲風災特別條例將花蓮全區劃定為災區，而0923花蓮馬太鞍溪堰塞湖災害，將依此特別條例延續補助方向，且丹娜絲特別預算本來就有編列堰塞湖處理預算，加上災害預備金也能因應。考量堰塞湖溢流導致之災損、農損、公共設施毀損及其他相關損失，災情特別嚴重，為加速救助金之發放，已由行政院陳政務委員金德多次召會及趕赴現地瞭解災民實際需求，提出程序簡化措施，並將於下週二(10月7日)由陳政委率各相關部會赴災區聯合成立「一站式服務平台」，提供相關救助措施之宣傳、諮詢及直接受理民眾申請，請各部會務必以「從速、從簡」原則認定發放各項救助金，以有效回應受災民眾的急迫需求。至有關死亡及失蹤者慰問金由中央發放每位100萬元部分，亦已於本(2)日由前進協調所總協調官季政委陪同蕭副總統赴瑞穗生命園區致贈罹難者家屬，並致上最深切的慰問之意。

此次堰塞湖災害讓國人再次體會國土韌性與防災體系都必須更強化，更重要的是，對後續災區復原重建以及類似情況如何做好檢討及處置，將是未來重點工作。經評估後續復原重建經費約需200億元，行政院將以最快速的方式採編列追加風災特別預算來因應，投入相關重建建設，請立法院各黨派委員全力支持；另外，也會妥善運用民眾善款，秉持「全力救災、迅速復原」的原則，妥善安置受災居民。同時呼籲社會各界齊心支持救災與重建工作，凝聚全民力量，共同守護家園，展現臺灣堅韌的社會韌性與團結精神。