為掌握我國地下水水質狀況，本院環境保護署自84年起，針對全國地下水分區共設置453口區域性監測井，以檢測地下水背景水質。歷經15年採樣檢測，目前已累積超過40萬筆地下水水質檢測數據。另90年起啟動高污染潛勢事業及工業區品質管理工作，累計設置1,916口場置性監測井，進行污染調查。
　　另為有效整合政府資源，99年起進行地下水監測資訊整合作業，彙整相關單位監測數據，亦掌握高污染潛勢區域，有效達到污染保護措施。由於地下水為我國重要水資源，涉及環保、農業、經濟等單位權責，故於本次院會報告「地下水水質保護策略」，說明地下水水質管理與資訊整合之精進作為，以達到地下水資源永續利用目標。
一、 強化污染監測
1. 完備地下水水質監測井網密度不足區域之補充建置。
2. 推動地下水三維分層監測井網聯合監測。
二、 整合跨部會資源
1. 加強我國地下水水質監測數據整合。
2. 聯合相關單位地下水水文地質調查資訊。
三、 建立預警與保護措施
1. 研析地下水水質趨勢並建立潛勢分布。
2. 推動環保、農業、經濟等跨部會地下水污染預防保護措施。