行政院院會今（25）日通過「國家中山科學研究院設置條例」草案，行政院長吳敦義表示，該條例草案主要目的在使中山科學研究院行政法人化，以活化其組織、人事與預算制度，引進企業化精神，俾能提升效率，確保公共事務妥善實施。吳院長要求國防部會同人事行政局、研考會等機關，配合立法院審議「行政法人法」草案進度，妥適與立法院、中科院員工溝通說明，尋求支持，俾中科院能早日完成組織轉型。

該草案內容要點如次：
(一)中科院為行政法人，監督機關為國防部。（草案第2條）
(二)中科院業務範圍、機密保護、採購規範及經費來源，並應擬訂組織章程、人事管理、會計制度、內部控制、稽核作業及其他規章，提經董事會通過後，報請國防部備查。（草案第2條至第6條）
(三)中科院設董事會，置董事11人至15人，監事3人至5人，任期為3年，期滿得續聘1次，由國防部遴選政府相關機關代表、相關學者專家等提請行政院院長聘任之。（草案7條至第9條）
(四)中科院置董事長1人，由國防部就董事中提請行政院院長聘任之，綜理院務；置院長1人，由董事長提請董事會通過後聘任之。（草案第10條及第14條）
(五)董監事及院長應遵守利益迴避原則等相關規定。（草案第15條至第18條）
(六)國防部監督權限、應邀集有關機關代表、學者專家及社會公正人士，辦理績效評鑑。（草案第19條及第20條）
(七)中科院應訂定發展目標計畫、年度營運計畫預算，並提報年度執行成果與決算報告，接受國防部績效評鑑。（草案第21條及第22條）
(八)原機關現有人員之移轉安置、權益保障及新進人員權利、義務。（草案第23條至第32條）
(九)政府機關核撥經費，應依法定預算程序辦理，並受審計監督；舉借債務以具自償性質者為限，並先送國防部核定；辦理採購，應本公開、公平原則等；資訊公開及對該院所為行政處分不服者，得依訴願法規定，向監督機關提起訴願。（草案第37條至第43條）
(十)施行日期由行政院定之。（草案第44條）