行政院長吳敦義今(3)日抵高雄市政府防災應變中心，視察高雄市防災整備情形時強調，在88水災之後，對防颱、防洪及救災工作，全國不分軍民一致投入，中央與地方是一體的，雖然在防救災工作上，地方是主體，但是中央一定會全力支援，與地方緊密的結合。院長並期勉中央與地方，同舟共濟，肝膽相照，共同防範及面對災害的侵襲。
吳院長指出，今天馬總統前往花蓮、台東視察，他則分別視察高雄縣、高雄市及屏東縣，其他的部會首長也分別到不同的區域，主要就是要與各縣市政府建立堅強的共識，大家在第一時間防災，必要時進行救災。吳院長說，國軍也已遵照總統指示，迅速地進行兵力配置布署工作，在二十幾個縣市分成5個作戰區，各縣市分別派駐上校級指揮官與各縣市聯繫，投入各縣市防災中心，各鄉鎮亦分別有少校或上尉以上軍官進駐，而村里則有後備系統的小組長分別與村里長聯繫，當黃色警戒發布，預置的兵力將進入各縣市敏感的區域，隨後再視救災的需要，投入必要裝備及機具，共同投入救災的工作。
針對高雄市政府提出旗津海岸公園侵蝕嚴重，但具觀光效益，希望中央能補助7億元協助籌建，吳院長表示，將請經濟部研議，但恐無法全額補助。
吳院長表示，經濟部在今年七月曾公告恢復柴山採礦，由於他曾任高雄市長，深切體認高雄市民意，已在上任院長後，請行政院林秘書長協調，於九月份予以撤銷公告。對於高雄市政府在視察報告中，提出除了禁止柴山採礦之外，希望爭取中央同意成立自然公園，吳院長特別表達支持柴山可以成立國家公園或成立國家級的觀光風景區。
吳院長表示，治水工作是「要命」的國家建設，政府正在著手規劃水患過後的清除污泥砂石工作，將推動土方銀行的計畫，利用台糖一或二百公頃的土地做為中繼場，同時規劃砂石的去處，例如在濁水溪的砂石，可以提供濁水溪出海口國光石化填出兩千公頃的用地，而在南部地區應也有上億噸的砂石需要處理，院長希望在場的高雄市長陳菊能夠支持，提供高雄港填海造陸的南星計畫，作為部分砂石的去處。
院長指出，為因應高雄縣市未來合併升格，未來大高雄市因有高雄縣廣大的發展腹地，他已指示經建會及交通部，對高雄市的重大建設予以支持。