關心水資源運用情形，行政院長吳敦義今(27)日特地前往高屏溪流域及台南縣南化水庫，視察水利工程建設，並訪視「杉林月眉大愛村」興建進度。吳院長首先視察「高屏溪攔河堰下游疏濬工程」，感謝國軍官兵不辭辛勞投入高屏溪疏濬工程，當場致贈柳丁禮盒慰問並與國軍五四工兵群國軍弟兄合影留念。

吳院長在視察此項工程後指示經濟部應律定清運6500萬立方公尺砂石為目標，解決水災的禍害來源必須排定優先順序，尤其是清運河川淤積的砂石應列為首要工作。吳院長表示，為落實馬總統的政策，將國軍參與防災救災列為法定任務，吳院長並要求國防部配合災害防救法的修訂，儘速妥善規劃工兵員額及機具設備向行政院提報。

吳院長接著前往高雄縣旗山鎮視察「月眉農場土石儲備中心暨高屏溪流域整體疏濬計畫」，指示經濟部應靈活運用土石儲備中心（土方銀行）的砂石，日後可做為高屏溪沿岸公共工程、慈善建設之用。赴南化水庫淨水場前吳院長訪視「杉林月眉大愛村」興建進度，除了感佩慈濟基金會不分性別、貧富及宗教信仰，以民間之力投入災民永久屋興建外，更希望在明（98）年1月31日前完成第一期工程，讓災民能在農曆春節前遷入。吳院長還要求經濟部提前於明年1月15日完成供電，讓災民免於摸黑搬遷；另973件永久屋申請案目前僅通過114件，吳院長指示高雄縣政府和有關單位必須加緊認證程序。吳院長表示，唯有中央與地方政府一同努力，秉持「熱誠、行動、細膩、貼心」的理念，才能讓災民在新家園安居樂業。

吳院長在聽取台灣自來水公司「南化水庫及抗旱供水調配」及經濟部水利署「南部地區水資源調配暨曾文水庫疏濬」簡報後，呼籲全民共體時艱節約用水，一起對抗可能面臨的旱災。至於政府要求農民休耕的補償部分，吳院長當場也回應台南縣長蘇煥智、立法委員與地方民意代表的請求，允諾將原本每公頃6萬元的補助，提高為每公頃8萬元，讓休耕的農民生計得以維持。