行政院莫拉克颱風災後重建推動委員會南部辦公室表示，莫拉克颱風造成全台公路系統242處災害，橋梁60座毀損，截至98年8月28日已搶通公路162處，並以便道搶通橋梁14座。
　
南部辦公室進一步指出，莫拉克颱風造成的道路阻斷包括國道5處、省道155處、縣道65處、鄉道17處，目前國道已全部搶通，省道102處、縣道42處、鄉道13處也已搶通，並正搶修其餘80處道路(省道53處、縣道23處、鄉道4處)中。橋梁部分，截至8月27日止，已有14座橋梁以便道搶通，其餘仍在積極搶通中。短程工作目標包括8月29日搶通台27甲線六龜大橋便道，8月30日搶通旗尾橋(僅供小型車通行)。

南部辦公室的資料顯示，莫拉克颱風造成道路損壞而對外交通完全阻斷的孤島區域計有八處，其中台9線太麻里段楓港已於98年8月22日全面開放通行。其他正在搶通的路段為：

(1)台21線甲仙至小林至那瑪夏鄉段，預計98年12月13日搶通。

(2)台27甲、20線六龜至荖濃至梅山段，目前已搶通至寶來，寶來至梅山路段預計99年2月28日搶通。

(3)台27線大津至茂林至多納段，目前已搶通至多納橋，預計98年10月21日搶通。

(4)台24線德文至霧台至阿禮段，目前已搶通至霧台，霧台至阿禮路段預計98年8月31日搶通。

(5)台18線阿里山公路，目前僅59K及71處大規模路基流失，預計98年9月20日搶通，其餘台18線路段已搶通。

(6)台21線水里至神木村至望高至塔塔加段，目前已搶通至望高，望高至塔塔加路段預計98年9月15日搶通。

(7)台20線霧鹿至利稻至啞口段，目前已搶通至利稻，望利稻至啞口路段預計98年9月20日搶通。