行政院發言人孫立群今（3）日表示，劣質豬油事件發生後，衛福部部長邱文達為表示負責，曾多次向江院長請辭，由於屏東地檢署今日偵結並起訴郭烈成等人，邱部長也正式向江院長提出書面辭呈。江院長今日中午與邱部長懇談後，正式同意邱部長請辭，並於今日晚間批准辭呈，衛福部部長乙職由政務次長林奏延暫代。

行政院表示，江院長相當感謝邱部長在這段期間的辛勞，同時也肯定其擔任衛生署署長及衛福部部長任內的諸多貢獻。邱部長是衛生署最後一任署長，同時也是衛福部第一任部長。他在任內完成衛生與福利的整合，讓衛生福利部順利於102年7月23日成立，開啟我國衛生福利行政的歷史新頁。

行政院指出，邱部長在任內順利完成二代健保的改革，截至今年累計結餘已超過一千億，可以說是世界上少數健保改革成功並獲得高滿意度的國家。邱部長也積極因應我國醫療體系目前所遭遇的困難，包括解決五大皆空的人力問題、推動護理改革十大策略、提升偏鄉離島醫療水準、降低醫療訴訟案件、處理H1N1及H7N9流感疫情，以及改革署立醫院的弊案等等。