為捍衛全民健康，邁向食品藥物管理新紀元，行政院衛生署於民國99月1月1日新年第一天在台北市南港區昆陽街正式成立「食品藥物管理局」，並舉行成立揭牌儀式及新任局長康照洲宣誓就職典禮，行政院長吳敦義主持揭牌並致詞期勉該局責任重大，期許該局「藥求安全，食在安心」，為民眾的用藥及食品安全嚴格把關。
吳院長同時要求「食品藥物管理局」，為達到「藥求安全，食在安心」的目標，必須做到三要件：首先是「正確」，在各項檢驗及評斷方面要正確；其次是「快速」，各項申請及待審案件要快速；第三是「親切」，政府機關的公共服務，親切十分重要。
吳院長說，此次食品藥物管理局的成立，是將食品管理及藥物管理的相關機關合併，是事權統一、發揮效能的最好表現。吳院長並特別以食品管理為例，他表示從五星級的大飯店到路邊攤，任何時間、任何地點，食品管理都十分重要，必須費心管理，因此他期許新任局長康照州，要盡最大的努力保護台灣的食品及藥物安全。