針對媒體報導行政院公告我國領海基線未包括金馬地區，行政院新聞局長蘇俊賓指出，依中華民國領海及鄰接區法第5條規定，行政院得分批公告我國領海基線及領海外界線。政府係於民國88年公布第一批領海基線，當時係考量兩岸關係特殊，故暫未將金馬地區列入，目前該區仍為我國實質管轄範圍，我國在研訂領海基線過程中，從未放棄金門馬祖地區。
蘇局長進一步指出，本（98）年11月18日經內政部報陳行政院公告的領海基線修正案，係為求領海基點坐標精確，僅針對民國88年行政院公布之我國第一批領海基線進行實地檢核。
蘇局長表示，自民國88年政府公告領海基線暫未列入金馬地區迄今已十年，其間歷經政黨輪替民進黨執政8年亦仍維持此一公告內容。蘇局長強調重申，此次公告僅係對88年第一批公告時的領海基線作實地檢核，金馬地區是我國實質管轄範圍，在研訂領海基線過程中，從未放棄金門馬祖地區。