行政院莫拉克颱風南部救災指揮中心今(13)日公布最新的搜救結果，截至今日下午6時止，共出動國防部直升機119架次、內政部空勤總隊直升機25架次，以及空軍海鷗直升機，赴高雄縣桃源鄉、那瑪夏鄉、茂林鄉、六龜鄉、甲仙鄉，嘉義縣阿里山鄉、梅山鄉等地執行救災任務，今日共救出2200人，搜獲2具大體。
國防部今日另投入地面兵力13448員，前往台南縣、台南市、高雄縣、屏東縣等縣市共34個地點，進行搜救失蹤人員、物資運送、疫情防治、大型廢棄物清理及淤泥清理等工作。另投入陸軍特戰部隊305員，進入高雄縣、屏東縣、南投縣、嘉義縣共9個鄉搜索，並協助災民撤離及安置。
針對受困失聯的災民，國防部擬進一步派直升機沿主要道路進行搜索，如遇需協助民眾，國軍將立即標定民眾位置，以利派員進駐救援。
行政院長劉兆玄今日也宣布將派遣50組特戰部隊前進災區救援，採輻射狀進行搜索，確實掌握災區受困民眾人數，並進行必要的救援。對於不願意離開住所的災民，也會將資訊傳回救災中心，以利提供後續援助。