行政院長吳敦義今(15)日在行政院會聽取行政院衛生署「H1N1新型流感疫情防治現況」報告後表示，根據衛生署的說明，政府目前所採取的各項防疫措施比九月份更獲民眾肯定，不過隨著時序進入秋冬，將進入新型流感活躍期，國人絕不能掉以輕心，他勉勵行政團隊應嚴陣以待，做好準備。
針對衛生署預訂於11月展開的H1N1疫苗接種工作，吳院長肯定衛生署同時成立疫苗事件危機處理小組，即時澄清媒體訊息的作法。他表示，根據專家估計，每施打一百萬劑疫苗可能會有一例發生問題，若出現問題案例，有可能造成醫療糾紛，並造成不必要的恐慌，如能透過專業、深入並具公信力的危機處理小組進行適時適切的說明，能將可能造成的負面影響降到最低，相關同仁應做好準備。
吳院長說，他10月10日曾訪視國光生技公司，國光生技是全亞洲最新最大的新型流感疫苗生產工廠，採用歐盟最新最高的標準生產疫苗，廠房管制週密嚴謹，標準及設備都是全球第一流，他對國光生技生產的疫苗有信心。他指出，目前衛生署已籌妥相關行政費用，也獲得醫界的支持，由政府支應每人每次150元的新流感疫苗接種處置費，衛生署應同時嚴格管控疫苗生產、進口及施打的進度。他並指示相關工作同仁應落實執行十一月起對低收入戶民眾開始發放免費口罩的工作。
吳院長最後提醒國人，良好的自主健康管理與預防接種，是面對H1N1新型流感的最佳防護；國人充分瞭解及配合，是防疫成功的重要關鍵，他指示指揮中心充分運用傳播媒體發布疫情正確資訊及衛教知識，加強國人信心，並指示新聞局及國家通訊傳播委員會全力協助。