針對凡那比颱風高雄市政府請求中央補助淹水事項，行政院副院長陳冲今（27）日召開跨部會研商會議。行政院表示，就民眾關心泡水車補助部份，將依財政部建議於汽車停用期間得向監理機關申請按比例退還牌照稅，另每戶災損在新台幣15萬元以下者，僅需由村里長或村里幹事簽章證明，災損超過15萬元以上者可檢附相關證明文件，向國稅局報備均得於申報綜合所得稅時列為扣除額，政府不另予補助。

對陳菊市長所稱，吳院長十餘年前擔任高雄市長時，曾報請中央同意補助泡水車一節，經行政院調卷查明，陳市長所稱並非事實。行政院表示，民國87年6月吳敦義擔任高雄市長時，高雄市政府曾向中央申請水災災後補助款9200餘萬元，惟當時中央僅核准4920萬元，係用於補助災後抽水及修復消防機電設備等用途，並未核准泡水車補助及防水閘門補助之所需相關款項。

有關補助民眾安裝防水閘門方面，行政院表示，對此次地下室嚴重淹水之數百棟大樓住戶並未領取淹水補助款，中央將全額補助其裝設防水閘門，其餘仍依內政部去年訂頒的原則，中央給予一半補助。