報載莫拉克颱風造成大樹鄉轄高屏溪右岸區域排水及無尾溝出口阻塞等情形，行政院莫拉克颱風災後重建推動委員會南部辦公室表示，經濟部水利署第七河川局及南區水資源局，於莫拉克颱風後，即要求簽約廠商至高屏溪沿岸排水及溪溝出口清理疏通淤土。針對高屏溪大樹鄉河道規劃疏濬工程，預計於本（98）年10月間，即將陸續發包施工執行疏濬，計畫可於明（99）年汛期前完成大樹鄉轄高屏溪右岸區域排水及無尾溝出口河段疏濬工作。

南部辦公室進一步表示，經濟部水利署近年於高屏溪高屏堰及附近河段疏濬土石數量共計約690.79萬立方公尺（95年96.98萬、96年278.71萬、97年162.99萬、98年至8月152.11萬立方公尺），並無長期未疏濬情形。