行政院長陳冲表示，目前腸病毒疫情雖已過流行高峰，但仍未平息，易導致重症的腸病毒71型，並已造成2例死亡，再過幾天學校陸續開學後，可能提高腸病毒傳播的機會。他要求衛生署密切監視疫情、充實醫療量能，並持續與教育部、內政部及地方政府密切合作，做好托育機構之衛生管理與民眾衛教宣導等防疫作為，妥適防範開學後的疫情，確保學童健康。
陳院長今(30)日在行政院院會中聽取衛生署「腸病毒、登革熱疫情及防治作為」報告後，作以上裁示。
陳院長指出，目前登革熱境外移入病例數倍增，主要來自東南亞國家，且臺南、高雄等地仍持續出現本土病例，加上近期颱風帶來豪雨之影響，疫情有擴散趨勢，必須嚴加注意。
而對於登革熱疫情的防治作為方面，陳院長也強調清除孳生源與及早偵測疫情為防治登革熱的首要工作，請衛生署隨時掌握、即時公布國內外最新疫情，並積極協調各部會及地方政府共同加強病媒蚊孳生源清除工作。
衛生署表示，將持續透過新聞稿、致醫界通函等管道，將最新疫情訊息提供醫師、旅遊業人員等，請其提高警覺。並敦請教育部轉知學校組團出國旅遊、競賽、擔任志工或外籍生入學，應宣導自我保護等防治措施。同時依法派遣機動防疫隊，督導地方政府病媒蚊孳生源查核工作，必要時擴大派遣防疫隊，提供專業技術支援。