行政院發言人孫立群今（11）日表示，院長江宜樺關切海研五號事件，在第一時間獲悉後，即責成交通部成立中央災害應變中心，進行跨部會搜救作業。對於後續海研五號事件的事故調查，江院長已指示交通部專案處理，以釐清事故發生的原因；對於海研五號事故受傷研究員與船員的醫療照護，則請科技部、衛生福利部協助，掌握傷者的復原狀況；對於不幸罹難受難者的家屬，也請相關部會充分協助，並主動提供應有的服務。

孫發言人指出，至於海研五號後續是否可能有漏油，造成海洋污染問題，江院長也指示行政院環境保護署持續監控，備妥攔油索做好萬全準備，避免污染事件發生。

孫發言人說，由於昨晚海象相當差，江院長對於此次事件參與應變、救援作業的單位，包括：交通部、行政院海岸巡防署、國家搜救指揮中心、空中勤務總隊及國軍動員人力及機艦全力救援，有效率的將人員全數救起，表示感謝與肯定；同時，對於澎湖縣政府即時成立應變中心協助，也表達感謝之意。

孫發言人表示，海研五號事件後續將由交通部，持續成立緊急應變小組處理因應。