除推動中醫人才培育及優化臨床訓練品質外，並提供中西醫整合及多元之中醫醫療照護服務；加強中藥材與中藥製劑之安全與品質管理，對於中藥的製造與販售，建立相關品質查核規範、實施中藥廠GMP制度，至113年計有80家GMP中藥廠。為與國際藥政管理制度協和，業於107年9月20日公告「中藥優良製造確效作業基準」，針對生產濃縮製劑之中藥廠，已自109年1月1日起分四階段實施，截至113年計有10家中藥廠通過確效作業查核，提升中藥品質管理，符合國際市場之要求。110年9月13日公告《臺灣中藥典》第四版，自111年6月1日實施，正文共收載394個品項，新增3個中藥材、30個中藥材飲片及7個中藥製劑，健全中藥品質管制規格，提升製藥產品之品質與促進產業發展。

為加強源頭管理，衛生福利部自101年起實施中藥材邊境查驗制度，凡輸入經公告應施查驗之中藥材，報驗義務人須檢附檢驗證明文件，經查驗合格才能輸入，以阻絕不安全中藥材於境外，至113年紅棗、黃耆等21項中藥材執行邊境查驗；並執行市售中藥（材）抽驗，保障民眾中藥用藥安全。又為提升中藥（材）品質，公告實施中藥材含異常物質包括：105年訂定二氧化硫、黃麴毒素及重金屬之限量基準；並於113年11月6日發布令訂定《中藥材農藥殘留限量基準》，精進中藥材異常物質管理制度，確保中藥品質與安全。

《中醫藥發展法》於108年12月31日總統公布實施，已確立國家中醫藥發展之基本原則。為落實推動其法定業務，衛生福利部並已訂定相關子辦法，業於109年11月發布《上市中藥監測辦法》及《中醫藥發展獎勵或補助辦法》，110年10月發布《承租公有或國營事業土地種植中藥藥用植物獎勵及租賃期限保障辦法》。為促進中醫藥發展，衛生福利部自109年起推動中醫優質發展計畫，以健全中醫醫療及照護體系，並自111年5月起推動中醫藥振興計畫，以強化中藥產業發展，提升國際競爭力。