為強化「食安五環」之源頭管理及查核檢驗，食品安全辦公室整合中央跨部會資源，強化機關橫向聯繫，建立系統性查核機制，結合源頭管理策略，選定重大民生必需及高風險食品，督導中央部會會同地方政府共同執行稽查工作，加強製造場所（含工廠）查核及產品抽樣，自103年10月食品安全辦公室成立迄今，已完成聯合稽查之行動類別及產品品項如下：
- 重大民生必需及一般消費性食品：油品、麵粉、鹽、蛋品、水果、早餐食材、預拌粉及澱粉、學校午餐。
- 風險較高食品：芽菜、生鮮截切蔬果及液蛋
- 其他重要食品：花茶及茶葉類手搖茶飲、包裝盛裝飲用水與加水站及其水源、夜市攤商及所使用原物料（含其源頭供應商查核）與食品相關廢棄物流向、冰塊製造業、兼售食品添加物之化工原料行等聯合稽查。另協調衛生、農業、環保機關加強年節前斃病死畜禽查緝及研商畜禽下腳料管理機制，為食品安全把關。
為加強食安查核管理，同時配合食安五環相關政策之推動，110-111年「食品安全聯合稽查專案小組」規劃執行跨部會聯合稽查專案。
業務用半成品食材製造業者稽查專案
110年9月至111年4月分三階段執行，先調查供應校園午餐及連鎖早餐店等食材供應商，進一步稽查來源製造業者，並逐層往上追溯原料肉，直至進口輸入商或國內畜牧場，結果查獲少數業者因違反產品標示及食品添加物之使用規範，已依「食品安全衛生管理法」裁處3萬至6萬元。另肉品供應來源之調查是本次聯稽之重要查閱項目，經農政與衛生單位透過業者進貨單或豬隻購買證明等資料，可溯源至進口商或至國內來源畜牧場。
市售茶品產地標示稽查專案
110年9月至111年2月分三階段實施，分別就量販超市或茶行、輸入茶葉下游業者及販售春節茶葉禮盒之商店，共計抽驗183件樣品進行茶葉產地鑑別，檢驗結果其中36件含有非臺灣茶，均已移送檢調單位積極偵辦調查。而為強化國產茶溯源管理，農委會將依「農產品生產及驗證管理法」，公告臺灣茶葉納入強制性溯源品項，並應於產品包裝明顯處張貼溯源標章（產銷履歷標章）或「國產茶溯源碼」。另衛福部、農委會已與臺灣高等檢察署合作，持續透過「打擊境外茶混充臺茶案件協調督導小組」，跨部會稽查高風險業者，保障消費者選購國產茶權益。
食品安全辦公室將持續推動食品安全聯合稽查工作，透過跨部會、跨領域的查核管理，完善從農場到餐桌的治理體系，維護民眾的飲食安全，邁向信任食安的消費環境。
